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アミノトランスフェラーゼおよびアルカリホスファターゼは一般的に臨床検査セットに含まれるため，肝疾患の徴候または症状を伴わない患者からもしばしば異常が検出される。このような患者に対して医師は，肝毒性の可能性がある次の物質への暴露歴を聴取する。アルコール；処方薬および非処方薬，ハーブティー，治療薬；職業性またはその他の化学物質。ALTまたはASTの単独で軽度な上昇（正常の2倍未満）がみられる場合必要となるのは再検査のみである；これで約1⁄3の症例は解決する。その他の臨床検査で異常が認められ，それが重度またはその後の検査でも持続する場合，さらなる評価が適応となる。
アミノトランスフェラーゼ上昇のさらに進んだ評価には脂肪肝の検討が含まれ，これはしばしば臨床的に疑われる。脂肪肝がみられない場合，B型およびC型肝炎のスクリーニングを行うべきである。40歳以上の患者についてはヘモクロマトーシスのスクリーニングを行い（鉄過剰: 原発性ヘモクロマトーシスを参照 ）；30歳未満の患者についてはウィルソン病のスクリーニングを行うべきである（ミネラルの欠乏症および中毒症: 先天性銅中毒症を参照 ）；ほとんどの患者，特に若年または中年の女性については自己免疫疾患のスクリーニングを行う。危険性のある患者についてはマラリアや住血吸虫症のスクリーニングを行う。この時点で結果が陰性であれば，α1-アンチトリプシン欠損症のスクリーニングが適応となる（慢性閉塞性肺疾患(COPD): α1アンチトリプシン欠損症を参照 ）。全ての評価を行っても原因が特定できない場合，肝生検の適応となる。
無症状の患者で，アルカリホスファターゼ値の単独上昇がみられる場合，5'ヌクレチオダーゼまたはγグルタミルトランスペプチダーゼの上昇によって，肝原性であることの確認が必要となる。肝臓に由来することが確定した場合，肝の画像診断（通常は超音波や磁気共鳴胆管膵管造影）が適応となる。画像診断にて構造的異常が認められなければ，可能性として肝内胆汁うっ滞が考えられ，薬剤や毒素の暴露歴から示唆されることもある。浸潤性疾患および肝転移（例，結腸癌による）も考慮するべきである。女性では，抗ミトコンドリア抗体を測定するべきである。原因不明の数値上昇が継続する場合や，肝内性胆汁うっ滞が疑われる場合には，肝生検を検討する。
最終改訂月 2005年11月
最終更新月 2005年11月
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